Ich hatte früher mit meinen Schafen auch öfter das Problem, dass ich auf das Grundstück kam und es waren keine mehr zu sehen (trotz Marken). Schnell hörte man aber ein Blöcken von den Viechern.
Es stellte sich dann schnell raus, dass sie manchmal einfach nur nicht angezeigt werden. Teilweise tauchten sie dann innerhalb weniger Minuten wieder auf. Wenn ich dann später nochmal aufs Grundstück gekommen sind waren sie meist alle wieder da. Vielleicht sind die Villager ja auch nur versteckt.