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Bei Wasser vs. Redstone gewinnt das Wasser, nicht das Redstone. 
Du hast die Eimer mit "Scheinwasser" gefüllt. 
Er leert sich höchstwahrscheinlich bereits, sowie du ihn in die EC packst.
Das ganze passiert, wenn du aus einem geschützten Bereich (darunter fällt auch der Bereich um den Farmwelt-Spawn herum) Wasser nimmt. Der Eimer füllt sich dann zwar grafisch, aber du hast den abgeschöpften Wasserblock nicht wirklich im Eimer drin, weil der Vorgang serverseitig unterbunden wurde.
Das ist zwar auch ein Bug, aber eher ein Minecraft-Bug.
Fliege mal in der Farmwelt etwas weiter hinaus und hole dort Wasser, wo du auch abbauen kannst. Dann hast du richtiges Wasser im Eimer, welches du auch verwenden kannst.
Ähnlich isses bei Lava.
