Ich wüsste leider nicht, wie man erkennen kann, ob jemand X-Ray benutzt, da X-Ray quasi nur bestimmte Blöcken unsichtbar macht. Das ist so, als könnte man irgendwie erkennen, welches Texture-Pack jemand benutzt und selbst wenn man die Modifikation erkennen könnte, wären da noch die X-Ray Texture-Packs. Da bin ich mir zu 100% sicher, dass man diese nicht erkennen kann.
Ach und dass manche Stein-Blöcke durch Erze ersetzt wird, ist bei jedem so und nicht nur bei X-Ray Nutzern. Das sieht man auch daran, dass man ab und an beim Abbauen von Stein hinter dem Blöck kurz ein Erz sieht.